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Die Gesellschaft für Medizinische Ausbildung arbeitet mit verschiedenen Organisationen eng zusammen. Die Aufzählung erfolgt in alphabetischer Reihenfolge:

AMEE International Association for Medical Education
Arbeitsgemeinschaft der Wissenschaftlichen Medizinischen Fachgesellschaften e.V. (AWMF)
Arbeitskreis für die Weiterentwicklung der Lehre in der Zahnmedizin
Bundesministerium für Gesundheit
Bundesvertretung der Medizinstudierenden in Deutschland e.V. (bvmd)
German Medical Science GMS
Hochschulrektorenkonferenz
Institut für Didaktik und Ausbildungsforschung in der Medizin des Klinikums der Universität München (DAM)
Kompetenznetz Medizinlehre Bayern
LehrehochN
LehrehochN – Der Film
Medizinischer Fakultätentag MFT
Robert Bosch Stiftung
Stiftung Tierärztliche Hochschule Hannover, E-Learning Beratung